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开源链接:https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills

科研 AI 技能全家桶：166 个跨行业科研 Agent Skills（科学版）

资源简介

这是一套 开源科研 AI 技能全家桶，源自 GitHub 47k 星标项目 K-Dense-AI/scientific-agent-skills。它把任何支持 Agent Skills 标准的 AI 编程助手（Claude Code / Codex / Cursor / Gemini CLI / Antigravity）变成「AI 科学家」，内置 166 个开箱即用的科研技能 + 100+ 科学数据库，覆盖生物信息、药物发现、医学影像、物理天文、量子计算、材料科学、地理遥感、机器学习等跨行业方向。

每个技能都是独立目录，含 SKILL.md 工作流 + 代码示例 + 参考文档 + 自测脚本，可单独拷走，也可整体作为插件包加载。

为什么推荐

• 覆盖广：从单细胞测序、分子对接、蛋白质设计，到天文坐标、量子电路、PIV 流场分析，一库包圆
• 确定性流程：每个技能 10~18 道质量门脚本检查，产出稳定可复现，不是拍脑袋
• 开箱即用：自包含目录，装进 Claude Code / Codex / Cursor 就能让 AI 调用
• 数据库直连：统一查询 PubChem、ChEMBL、UniProt、COSMIC、ClinicalTrials.gov 等 78+ 公共库，带溯源
• 文档能力齐：SCI 论文写作、文献综述、peer review、LaTeX 海报、PPT 科研海报、引用管理一条龙

兼容工具

Claude Code、Claude Cowork、Codex、Cursor、Google Antigravity、Gemini CLI、OpenCode 等一切支持 Agent Skills 标准的工具。

安装方式

bash
# 方式一：npx 一键装
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills

# 方式二：git clone
git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git

你觉得麻烦的话,那你就直接把压缩包丢给Agent，让AI帮你加载上去就行。

技能清单（166 个精选节选）

生物信息与基因组：scanpy 单细胞分析、bulk-rnaseq 转录组全流程、pydeseq2 差异表达、biopython 分子生物学、gget 20+ 数据库快查、phylogenetics 进化树、onekgpd 千人基因组查询

化学与药物发现：rdkit 分子操作、datamol 简化封装、deepchem 分子ML、diffdock 分子对接、molecular-dynamics 分子动力学、glycoengineering 糖基化工程

医学与临床：pkpd-modeling 药代药效建模、pyhealth 医疗深度学习、imaging-data-commons 癌症影像、pathml 数字病理、primekg 精准医学知识图谱

机器学习与数据：scikit-learn、pytorch-lightning、transformers、shap 可解释性、timesfm 时间序列、statistical-analysis 统计、optimize-for-gpu GPU加速

物理量子：astropy 天文、qiskit/cirq/pennylane 量子、sympy 符号计算、openpiv 流场、qutip 量子系统

数据可视化与文档：matplotlib、seaborn、scientific-visualization、scientific-writing、latex-posters、pptx-posters、citation-management、literature-review

文献与知识：paper-lookup 18 学术库、paperclip 全文文献、exa-search 学术搜索、markitdown 文档转换、ontology-term-resolution 术语解析

实验室自动化：opentrons 液体处理、benchling/labarchive ELN、omero 显微影像、dnanexus/latchbio 云工作流、ginkgo 云实验室

科研方法：experimental-design 实验设计、hypothesis-generation 假说生成、peer-review 评审、research-grants 基金申请、scientific-brainstorming 科学头脑风暴

注意事项

• 科研技能仅供研究用途；医学/临床类输出为研究草稿，需专业复核，不用于诊疗决策
• 每个技能目录内自带的 LICENSE 为准；整体仓库为 MIT，可商用
• 技能含可执行脚本，安装第三方技能前建议先安全扫描
• 这是开源资源整理，非本人原创，文章开头以保留原作者出处